功能性腸炎可通過一般治療、口服西藥、口服中成藥等方式治療，用藥期間需要嚴(yán)格遵照醫(yī)囑，患者不可以盲目用藥。
1、一般治療：
功能性腸炎的發(fā)病原因可能與飲食不規(guī)律有關(guān)，也有可能與飲食不節(jié)制有關(guān)，患病以后有可能會(huì)引起腹痛、腹瀉等癥狀。患病后應(yīng)注意飲食，三餐定時(shí)定量，不可以暴飲暴食，同時(shí)還應(yīng)避免吃辣椒、芥末等過于刺激的食物，應(yīng)以清淡、易消化飲食為主，可以適當(dāng)吃蘋果、黃瓜等新鮮的水果和蔬菜。
2、口服西藥：
患者也可以在醫(yī)生的指導(dǎo)下應(yīng)用保護(hù)腸黏膜的藥物治療，比較常見的藥物一般有蒙脫石散、膠體果膠鉍膠囊、硫糖鋁咀嚼片等。
3、口服中成藥：
也可以在醫(yī)生的指導(dǎo)下口服有益于腸道的中成藥治療，比較常見的藥物一般有腸炎寧膠囊、復(fù)方仙鶴草腸炎片、補(bǔ)脾益腸丸等。用藥期間不可以在癥狀有所減輕后就擅自停藥，否則有可能會(huì)導(dǎo)致疾病反復(fù)，不利于身體恢復(fù)。
除了以上比較常見的治療方式以外，必要時(shí)還需要加強(qiáng)心理管理，避免患者的心理壓力過大。
