姨媽結束后還有褐色分泌物，可能是由多種原因導致的，主要包括以下幾點：

1. 殘留經血：有時經期結束后，宮腔內可能還有少量未排出的經血，這些血液在排出過程中與分泌物混合，形成褐色分泌物。這通常是正常現象，無需過于擔心。
2. 激素水平變化：月經周期中，女性體內激素水平會發生變化。若激素水平波動較大，可能導致子宮內膜少量脫落，從而產生褐色分泌物。
3. 婦科炎癥：如宮頸炎、盆腔炎等，可能導致陰道或子宮出血，與分泌物混合后呈現褐色。這類情況需要及時就醫，進行針對性治療。
4. 宮內節育器影響：部分女性在使用宮內節育器后，可能出現不規則出血，導致褐色分泌物出現。如癥狀持續，建議咨詢醫生調整或取出節育器。
5. 藥物影響：某些含有活血化瘀成分的中成藥，可能在一定程度上影響月經。雖然這類藥物通常不會導致嚴重問題，但如出現異常情況，建議及時咨詢醫生。

除了以上幾點，還有可能是其他罕見疾病導致的。因此，如姨媽結束后持續出現褐色分泌物，建議及時就醫，以便專業醫生進行診斷和治療。同時，女性在用藥時應遵醫囑，切勿自行調整藥物用量或更換藥品。