流感病毒顆粒吸入呼吸道后,病毒的神經氨酸酶破壞神經氨酸,使黏蛋白水解,糖蛋白受體暴露,病毒依靠糖蛋白受體專一性的吸附于細胞表面。吸附是由病毒的血凝素引起的,具有特異性,它能被血凝素抗體所抑制,病毒穿入細胞時,其胞膜丟失在細胞外。
在感染早期流感病毒的RNA被轉運到細胞核內,在病毒轉錄酶和細胞RNA聚合酶的參與下,病毒RNA被轉錄完成,形成互補的RNA及病毒RNA合成模板,互補的RNA迅速與核糖體結合構成mRNA,在復制酶的參與下,復制出病毒RNA,再移行到細胞質中參與裝配。核蛋白在細胞質內合成后,很快轉移到細胞核,與病毒的核RNA合成核衣殼,然后移行至細胞膜部位,進行裝配。
病毒成熟前各種病毒成分,以結合在細胞表面,最后細胞膜向外隆起,包圍結合在細胞膜上的核衣殼,成為新合成的有感染性的新病毒體,復制周期為4-6小時,排出的病毒擴散感染到附近細胞,并使大量呼吸道纖維上皮細胞受感染,變性,壞死和脫落,產生炎癥反應。