由于藥物協同抗菌作用,聯合用藥時應將毒性大的抗菌藥物劑量減少,如兩性霉素B與氟胞嘧啶聯合治療隱球菌腦膜炎時前者的劑量可適當減少,從而減少其毒性反應。
聯合用藥時宜選用具有協同或相加抗菌作用的藥物進行聯合,如青霉素類、頭孢菌素類等,其他β內酰胺類與氨基糖苷類聯合應用。
兩性霉素B與氟胞嘧啶聯合,聯合用藥通常采用兩種藥物聯合,三種及三種以上藥物聯合僅僅適用于個別情況,如結核病的治療。
此外,必須注意聯合用藥后,藥物的不良反應將明顯增加,抗菌藥物聯合應用不適當的原因主要包括兩者有相同的毒性,兩者抗菌譜等同,兩者作用于細胞的同一靶位。