急性間質性腎炎可以有各種病因引起,最常見的是藥物和感染,其次是全身性疾病。其中藥物占到約50%以上,多見于抗生素,比如說利福平,卡那霉素,青霉素等等。
非甾體類解熱鎮痛藥,比如說安乃近,布洛芬,泰諾。抗代謝藥,比如別嘌呤醇。中草藥,比如含有馬兜鈴酸成分的關木通,馬兜鈴等等。華法林等抗凝劑等等。
感染如細菌,病毒,支原體等等。全身性疾病如系統性紅斑狼瘡,腎移植后急性排斥反應,干燥綜合征,腫瘤等等。
慢性間質性腎炎的病因以慢性腎盂腎炎和藥物最常見。其他包括急性間質性腎炎持續或進展,慢性尿路梗阻,腎毒性物質,腎結核,全身性疾病等等。