類風濕因子在類風濕關節炎的陽性率為80%左右,是診斷類風濕關節炎的重要血清血標準之一,但不是唯一的標準,類風濕因子也像抗核抗體一樣,特異性不高,可在多種疾病中出現,包括自身免疫性疾病,如干燥綜合癥,系統性紅斑狼瘡、系統性硬化癥、多發性肌炎和皮肌炎等。
感染性疾病如:細菌性心內膜炎、結核、麻風、血吸蟲病等,非感染性疾病:如彌漫性肺間質纖維化結節病,據球蛋白血癥等,部分類風濕關節炎患者類風濕因子陰性,不能排除類風濕關節炎的診斷,類風濕因子陰性是常規乳膠法測IgM類風濕因子陰性,如果臨床高度懷疑類風濕關節炎,應用其他方法,如在免疫復合物中進行類風濕因子的檢測。