第一,中毒性巨結腸,有5%的一個重癥潰瘍性結腸炎的患者可能合并有中毒性巨結腸。這個時候潰瘍病變比較廣泛而且比較嚴重,可以累積肌層和長期的神經叢,長臂張力減弱,結腸蠕動消失,腸內容物由于大量的積聚以至于急性的結腸擴張,一般以橫結腸為最嚴重的。常因為低鉀,鋇劑灌腸和使用抗膽堿能藥物和阿片類制劑會誘發。臨床表現的是急劇惡化,毒血癥十分明顯,有脫水和電解質紊亂以及腸鳴音消失的一些癥狀。
第二,直腸結腸癌變,主要見于廣泛性的結腸炎,病程大于二十年的患者發生結腸癌的風險比正常人要高十到十五倍的。
第三,合并有大出血,腸穿孔還有腸梗阻的情況。