如果患者確定肺膿腫后,首先要積極地使用抗生素的治療,包括使用對厭氧菌有效的青霉素族抗生素,可聯合應用奧硝唑、甲硝唑、克林霉素等對厭氧菌有效的藥物。某些厭氧菌,如脆弱類桿菌可產生β內酰胺酶,故青霉素效果差,可使用碳青霉烯類、頭孢西丁等藥物,加酶抑制劑也可增強,如阿莫西林、舒巴坦等。
院內獲得性感染形成的肺膿腫,多數為需氧菌,并有耐藥菌株的出現,故需選用β內酰胺類抗生素中的第二代、第三代頭孢菌素,必要時聯合應用氨基糖苷類。
血源性肺膿腫致病菌多為金黃色葡萄球菌,且多數對青霉素耐藥,應選用耐青霉素酶的半合成青霉素的藥物。對耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌,只需要使用糖肽類和利奈唑胺類。