在各種神經遞質當中,有關五羥色胺和孤獨癥這種關系研究的比較多,但是研究的結果也不是很一致,包括約三分之一的孤獨癥患兒,它血中五羥色胺水平增高,而且這種現象也存在于患兒的親戚當中。
在孤獨癥患兒當中,五羥色胺前提,色氨酸的水平明顯低于正常兒童,但是血清五羥色胺濃度沒有顯著異常,而孤獨癥患兒皮質和丘腦的五羥色胺合成減少,孤獨癥患兒的五羥色胺ea水平和這個正常兒童也沒有一個顯著的差異等等,還有一些研究報道了這個孤獨癥患兒的母親血漿的五羥色胺水平,明顯低于正常兒童母親,但是也有研究結果不一致的情況。
五羥色胺對于兒童腦的發育關系是非常密切的,那么除了作為一種神經遞質,五羥色胺對于腦發育具有一個神經營養因子樣的一個作用,還作為一種免疫調節劑,調控免疫反應。
除了五羥色胺以外,還有多巴胺和孤獨癥關系,除了個別研究發現孤獨癥患兒腦脊液、多巴胺代謝的一個產物高香草酸水平增高以外,多數的研究沒有發現孤獨癥患兒腦脊液多巴胺代謝產物的一個水平的增高。因此,多巴胺和孤獨癥之間的關系還需要進一步的一些研究。除了五羥色胺、多巴胺以外,還有一些孤獨癥的相關像γ氨基丁酸,谷氨酸的一些失衡。