克洛己新對寶寶的傷害,可能出現的副作用有:消化道癥狀,包括出現腹瀉,惡心、頭暈、腹痛和嘔吐。在長期使用頭孢類藥物時,可能會導致不敏感菌的大量繁殖,出現腹瀉,偽膜性結腸炎等消化道癥狀。個別情況下會出現暫時性肝臟不適,或膽汁淤積性黃疸。個別情況下會出現淋巴結腫大和蛋白尿,當停藥后幾天這些癥狀會自然消失。
過敏性癥狀,如皮膚斑疹,瘙癢、潮紅、呼吸困難、體溫升高,伴有寒戰等。服用頭孢類藥物后偶有紅斑滲出,剝脫性皮炎,斯蒂芬斯約翰遜綜合征。此外還可以出現無力,水腫、呼吸困難、暫時知覺喪失,心率加快等癥狀。應停藥服用,并應到醫院就診。
神經系統,下列情況很少出現,暫時的興奮,緊張不安、失眠、精神錯亂、張力增高,頭暈困倦。