一些草酸鈣、尿酸鹽及鎂類等可在腎、上輸尿管、膀胱、尿道形成不會溶解的沉淀進而發展成結石,約五分之一的腎結石病人是由于甲狀旁腺功能亢進,而呈現高濃度的血鈣,這些鈣和食物中的草酸結合成草酸鈣,在腎臟中定居就行成了腎結石。
至于結石的形成有許多內、外原因,如在一個核心的周圍不斷沉積化合物時就會產生結石,這個核心可以是細菌、纖維蛋白或血凝塊等,由于嚴重失去水分和食物中草酸攝入過多或尿阻塞或其他原因,引起這個核心的表面上溶解性低的化合物沉積,進而形成結石。
結石一旦形成就可能慢慢長大,除非在未長大之前就夭折,如因為運動、尿路肌肉的收縮隨尿排出體外。