男性的尿路感染大多數屬于復雜性的尿路感染,患者常常存在尿路結構的異常,曾有過尿路手術,或者是近期有過導尿史等。膀胱輸尿管反流和尿道瓣膜在泌尿系感染的男嬰中十分常見,可以引起腎臟斑痕和慢性腎損害,因此原則上講,對于所有的急性腎盂腎炎男性患者都應行影像學的檢查,以排除尿路形態和功能上的異常。
大腸埃希菌和其他的腸道桿菌仍然是主要的病原菌,男性的尿路感染患者治療選用磺胺甲基異惡唑、甲氧芐氨嘧啶、四環素類、或者是氟喹諾酮類,療程為十到十四天,禁用短程療法。治療失敗常常提示耐藥菌的感染,解剖結構的異常,或者是尿路中存在未知的感染灶,必須采用從非創傷性的現象到創傷性的檢查,來確定病變的部位和性質,進一步的指導治療。