念珠菌陰道炎也稱為陰道假絲酵母菌病，治療主要是消除誘因，根據患者的情況選擇局部或者全身應用抗真菌藥物。
第一個是消除誘因，如果有糖尿病的應積極的治療，及時停用廣譜抗生素，雌激素抑制皮質類固醇激素，勤換內褲，用過的內褲，盆以及毛巾均應用開水燙洗。如果是單純的外陰陰道假死酵母菌病的治療，可以局部用藥也可以全身用藥，主要是以局部短療程的抗真菌藥物為主，全身用藥與局部用藥療效相似，治愈率是80%到90%類，這類藥物的療效高于制霉菌素類。
局部用藥可用下列的藥物放于陰道內，一個是咪康唑栓劑每晚一粒，也就是二百毫克連用七日，或者是每晚一粒400mg連用三日或者是一粒1200毫克單次用藥。第二個是克霉唑栓，克霉唑栓每晚一粒150毫克塞入陰道深部連用七日，或者是每日早晚各一粒150毫克應用三日，是一粒五百毫克單次用藥。
第三個就是制霉菌素栓劑，每晚一粒十萬個單位，連用十到十四日，如果是全身用藥，對于不能耐受局部用藥者，未婚以及不愿意采用局部用藥者可以選用口服藥物，藥物是氟康唑150毫克頓服。
此病無需對性伴侶進行常規的治療，有15%的男性與女性患者接觸以后會有龜頭炎，對有癥狀的男性應該進行酵母菌的檢查治療，預防女性的重復感染，隨訪如果是癥狀持續或者是診后兩個月內復發者，需要再次復診，對于治療結束以后七到十四日，一個月、三個月、六個月各隨訪一次，三個月以及六個月，建議同時進行真菌培養。
