患者最好進食流食或半流食,如蛋、牛奶、粥、面條、香蕉等。檢查前一日不要吃富含纖維的蔬果,檢查當日進無渣流質或飲食或者是進食,以便清空腸道時比較方便。腸鏡檢查前三天應停服鐵劑藥品,開始進食半流質或是低渣的飲食,如魚、蛋、牛奶、豆制品、粥、面條、面包、香蕉、冬瓜、馬鈴薯等。
檢查前一天晚上服用輕瀉劑,第二天早晨可以口服硫酸鎂或者是甘露醇,同時應多飲水,必要時檢查前2小時清潔洗腸,檢查前半小時應安靜的休息。檢查時病人先取左側臥位,腹部放松并屈膝,檢查中按醫生的要求來更換體位,檢查中若有疼痛應立即向醫生訴說,便于醫生安插腸鏡,檢查后應休息一到兩天,如有劇烈的腹痛、腹脹、便血等情況發生,應立即的去醫院就診。