川崎病最嚴重并發癥是無菌性腦膜炎,疾病主要癥狀常見持續發熱五到十一天,甚至更久,兩周至一個月體溫常達39度以上,抗生素治療無效,常見雙側結膜充血,口唇潮紅、出血,見楊梅樣舌,手中硬結性水腫,十天后出現特征性指端大片狀脫皮,出現于甲床皮膚交界處,還有急性非化膿性一過性淋巴結腫大,以前頸部最為明顯,直徑約1.5厘米以上,大多在單側出現,稍有壓痛于發熱后三天內發生,數日后自愈。
發熱不久約一到四日即出現斑丘疹或多形紅斑樣皮疹,多見于軀干部,但無皰疹及結痂,約一周左右消退,其他癥狀往往出現心肌損害,發生心肌炎、心包炎和心內膜炎。