病毒性腦炎的診斷主要根據病史,臨床表現,腦脊液檢查和病原學鑒定,腦脊液檢查主要是壓力增高,外觀清亮,白細胞總數增加,多在三百乘以十的六次方每升以下,以淋巴細胞為主。
病毒性腦炎的檢查,少數患兒腦脊液白細胞總數可以正常,蛋白質大多數輕度增高或正常,糖和氯化物沒有明顯改變,涂片或細菌培養均為陰性。
病原學診斷,病毒性腦炎的病原學檢查主要有病毒分離,對于不同的病毒可以從不同的標本中進行病毒分離,提供病原學證據,具有就病毒性腦炎的確診價值,比如腦脊液、唾液、糞便、尿、皮損等,血清學檢測包括酶聯免疫方法、免疫熒光方法,用于病毒鑒定、病毒抗原檢測,特異性病毒抗體IGM和IGG檢測。