一般認為單純腎囊腫來源于腎小管憩室。隨著年齡的增長,腎小管的憩室越來越多,到九十歲時每個腎小管的憩室都會達到三個,故單純腎囊腫的發病率是隨著年齡生長越來越多。
囊腫可以分為單側或者雙側,可以是一個也可是多個。一般位于皮質深層或髓質,直徑2厘米左右,當然也有很大的,比如直徑達10厘米的囊腫。顯微鏡下囊壁被單層扁平上皮覆蓋,囊腫內容物一般與血漿濾出液相似,囊液更新率高達每天20次之多。
小于20歲的患者幾乎沒有單純性腎囊腫。若小于20歲的患者出現了腎囊腫,一定要高度懷疑腎臟先天發育問題或遺傳性腎囊腫性疾病。隨著年齡增長,腎囊腫的發病率會越來越高,30-40歲間,單純腎囊腫發生率大概10%,到八十歲就能達到50%。