首先克羅恩病屬于一種炎癥性腸病,主要是以腸道的潰瘍為主要癥狀。患者可以表現為腹痛、腹瀉、腹部包塊等不適的感覺,而且它的潰瘍也具有特征性的改變,通常是發生在消化道階段性的潰瘍或增生,在腸道內呈鋪路卵石樣改變等。而白塞氏病主要是以反復的口腔潰瘍,外陰潰瘍以及眼炎三聯癥為特點,同時還可以伴有血管、神經以及皮膚等損害。
克羅恩病雖然也有其他的腸外表現,比如葡萄膜炎、結節性紅斑等,但是一般癥狀比較輕微。而白塞氏病的腸道外表現比如口腔潰瘍,外陰潰瘍和眼炎是最常見的癥狀,并不是所有的白塞病患者都會出現腸道的受累。有的患者可以以血管受累為主,表現為動脈閉塞或者是靜脈血栓形成等。