真菌學鏡檢陰性說明了局部的感染灶沒有真菌,但是當患有腳氣時或者灰指甲時行一次真菌檢查,并不代表為非真菌感染性疾病。因為一次陰性,并不能說明問題,需要連續查三次,如果都為陰性,才可以基本上排除真菌性疾病。
臨床上有時癥狀不太典型時,或者外用激素藥物來治療真菌感染性疾病時,容易導致真菌鏡檢陰性。但是這并不能完全排除皮膚上為真菌感染導致,需要行第二次甚至第三次檢查。
當然臨床上也可以用真菌鏡檢和培養的這種檢查方法,來區別濕疹和股癬,或者說是濕疹和足癬的情況,濕疹培養多少次真菌都是為陰性的,而且皮疹的表現和真菌感染也是不一樣的。濕疹急性期以滲出為主,慢性期以苔蘚樣變為主,而真菌感染性疾病有它自身的一些特點。