在臨床上HIV相關腎臟病的病因主要是由于人免疫缺陷病毒,也就是HIV所引起的患者出現腎臟損害。患者病理表現是在光鏡下可以看到腎小球的典型病變,是塌陷性局灶即斷性腎小球硬化,患者會出現腎小球基底膜的扭曲、皺縮、塌陷以及毛細血管袢的管腔狹小,以球形塌陷最多見。
通過相關的特殊染色會看到患者的塌陷性病變皺縮和塌陷的腎小球基底膜外側,通常會出現足細胞肥大增生,有些會脫落至包埋式囊腔。而患者的免疫熒光檢查會提示IGM、C3呈幾段或球形分布于患者的腎小球內。患者的電鏡下表現是腎小球塌陷部位的腎小球基底膜,會出現扭曲以及皺縮,沒有出現或者是僅表現為輕度的腎小球基底膜增厚,有時還會出現足細胞肥大。