系統性紅斑狼瘡患者最常受到損害的臟器,包括皮膚黏膜以及腎臟,還有心血管疾病。另外,還包括消化道、血液系統以及肺臟受累,其中前兩者最為常見,尤其是皮膚表現,大約80%的患者在病程中都會出現皮疹,它的皮疹非常多樣化,既可以表現為典型的面部蝶形紅斑,也可以為盤狀紅斑或者是手指掌部以及指甲周圍的紅斑,也有的患者會在面部以及軀干出現一些散在的皮疹,這些皮疹大多數沒有明顯的瘙癢。
另外。患者也可以出現口腔以及鼻黏膜的痛性潰瘍,而對于腎臟損害也幾乎在所有的紅斑狼瘡患者身上都可以出現,只是有的患者他在臨床過程中沒有明顯的癥狀,患者可以以隱匿性的腎小球腎炎為表現,也可以表現為腎小球腎炎或者是腎病綜合征,嚴重的患者還可以出現急性腎功能衰竭等;而對于肺臟表現以及血液系統表現,在紅斑狼瘡患者身上也比較常見。