胃腸間質(zhì)瘤有一部分能夠治好，另一部分能夠控制。因?yàn)槲改c道間質(zhì)瘤，它起源于胃腸道間葉組織的軟組織瘤，是一種具有潛在惡性?xún)A向的侵襲性腫瘤。
臨床上根據(jù)腫瘤的大小、核分裂數(shù)以及發(fā)生的部位，分為極低風(fēng)險(xiǎn)、低風(fēng)險(xiǎn)、中等風(fēng)險(xiǎn)和高風(fēng)險(xiǎn)。
一般來(lái)說(shuō)，對(duì)那些低風(fēng)險(xiǎn)和極低風(fēng)險(xiǎn)，以及腫瘤沒(méi)有侵襲性的良性間質(zhì)瘤，是可以通過(guò)手術(shù)或者是內(nèi)鏡介入手術(shù)治愈的。而中等風(fēng)險(xiǎn)以上的胃腸間質(zhì)瘤，是存在復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的。
手術(shù)切除的原發(fā)性胃腸間質(zhì)瘤總的復(fù)發(fā)率大概在30%，絡(luò)氨酸激酶抑制劑，比如伊馬替尼，對(duì)不可切除和術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的控制率在50%以上。所以，胃腸間質(zhì)瘤一部分是可以治愈，一部分可以通過(guò)藥物控制，達(dá)到很好的生存期限。
