支氣管鏡的檢查首先應該掛呼吸內科進行診治,因為支氣管鏡檢查多要涉及到呼吸系統疾病。例如,肺炎、肺不張、支氣管結核、肺部腫瘤、肺部占位等改變。通過呼吸科醫生根據其肺部病變選擇支氣管鏡的檢查,通過此檢查可以明確肺部病變的原因。如由細菌感染引起的肺部感染,此時多需要予以有效的抗生素抗感染治療。當支氣管鏡刷檢找到結核桿菌時,多需要予以有效的抗結核治療。
對于部分患者因肺癌引起的肺不張,如果患者此時處于終末期,患者多需要經過呼吸內科醫生予以化療、放療、分子靶向藥物等綜合治療。但對于早期肺癌的患者,可以通過協同胸外科一起來治療。胸外科醫生評估其有無適應癥,予以早期手術切除能達到臨床治愈的目的。