十二指腸潰瘍比較典型的癥狀是疼痛,大多是饑餓痛或者夜間痛,這種疼痛呈周期性的發作,發作期可以為數月或者數周,長短不一,有時有季節性,多在秋冬或者冬春交界時候發病,這種疼痛可以應用抑酸藥緩解。而部分患者沒有典型的癥狀,僅僅表現為腹脹,惡心,食欲不振,噯氣或者反酸等消化不良的癥狀。
臨床上有相當一部分患者是以并發癥為首發表現入院的,有的患者直接表現為消化道出血,如嘔血或黑便等;而有的患者為穿孔,表現為劇烈的腹痛,彌漫性腹膜炎的表現;有的患者表現為幽門梗阻,大多是明顯的上腹脹痛,惡心嘔吐,嘔吐是宿食,大多是因為球部的潰瘍引起的梗阻導致。