白塞氏病目前尚無特效藥物可以根治的,所以通常是需要終生治療。要根據患者具體的病情來選擇個體化的治療原則,白塞氏病是一種多系統多器官受累的慢性全身性的疾病,基本病理改變是血管炎。在治療方面,對于口腔潰瘍可以采取局部治療的方法,比如涂抹含激素制劑的藥膏或者治療口腔潰瘍的膏劑來減輕疼痛,促進潰瘍愈合,也可以應用康復新液來進行漱口,局部可以噴一些錫類散噴劑等來治療。
另外生殖器潰瘍可以應用高錳酸鉀溶液清洗,再涂抹抗生素的藥膏。此外,當造成眼睛,血管,神經,胃腸道等重要臟器損害時,要積極應用藥物治療的,往往需要應用糖皮質激素聯合免疫抑制劑來共同治療。常用的免疫抑制劑有環磷酰胺,環孢素a,雷公藤或者硫唑嘌呤等。當然,必要的話還可以使用生物制劑來共同治療。