除了一些一般的治療方法，比如對癥的降壓，控制血糖的治療以外，還包括最主要的治療方法溶栓治療，溶栓治療的時間窗控制到3小時到4.5小時以內，主要的溶栓藥物是阿替普酶，溶栓時間嚴格把控有助于減少出血性風險的這一并發癥。
還有主要治療方案是抗血小板治療，抗血小板治療在腦卒中后48小時內口服阿司匹林。對評分小于等于三分的，可以啟動阿司匹林聯合氯吡格雷進行治療，治療的時間是21天。對大面積腦梗死的降壓治療，嚴重腦水腫和顱內壓增高是急性重癥腦梗死的常見并發癥，對發病48小時以內，六十歲以下的惡性大腦中動脈梗死伴嚴重顱內壓增高，外科減壓術可以降低死亡率和致殘程度。對壓迫腦干的大面積小腦梗死患者，也可以考慮積極的外科干預。
其他的治療還包括一些抗凝治療，抗凝治療并不能降低卒中病死率和致殘率，但是對于嚴重偏癱的患者抗凝治療可以預防下肢靜脈血栓形成和肺栓塞。當然抗凝治療也有適應癥，比如患者合并有動脈夾層，這一部分患者可以酌情評估患者的風險利弊后可以酌情使用抗凝藥物。
患者一定要做好卒中的二級預防，包括控制危險因素，比如高血壓、高血糖的控制，還有就是他汀類藥物的使用來防止斑塊的脫落。還有如果有心源性栓塞的患者要進行抗栓治療，可以使用口服華法令或者是口服達比加群等的藥物來改善心源性卒中的再次發生，非心源性的藥物主要是使用的阿西匹林和氯吡格雷。
