關節外科（骨三科）是骨科中心三大專業科室之一，2015年3月成立，為我院新成立科室，也是是航空總醫院近年來發展最快的科室之一。2017年引進我國著名的北京積水潭醫院矯形骨科資深知名專家，主任醫師，國務院特殊津貼專家郭曉忠擔任科室主任

各類關節相關的常見病、疑難病的診斷和保守治療以及手術治療，包括股骨頭缺血壞死的早、中、晚期的診斷和手術治療、髖、膝關節疾病的診斷和手術治療、各種骨關節畸形的診斷和手術治療、足部疾病和畸形的診斷和手術治療、人工全膝關節置換術、人工全髖關節置換術、人工全髖和全膝關節翻修術、各種復雜的關節畸形矯形手術、肢體不等長延長手術、導航（智能化）髖膝關節置換手術；獨創微創的單一入路雙孔道減壓植骨（異體骨）+結構性骨支撐手術；髖、膝關節置換手術；保頭手術；骨關節畸形矯正手術和髖膝關節翻修手術等各種手術。