安徽醫科大學第一附屬醫院前身為上海東南醫學院附屬東南醫院，創辦于1926年。1949年響應黨和政府號召，隨校內遷至安徽懷遠縣，1952年再遷至合肥市。經過80多年的發展，醫院已成為國家衛生部三級甲等醫院，全國衛生系統先進集體，衛生部臨床藥理基地，安徽省文明標兵單位，是安徽省規模最大的、集醫療、教學、科研、預防、康復、急救為一體的綜合性教學醫院。

醫院目前占地面積224.9畝，總建筑面積28萬平方米。現有在職職工2100人，開放病床1890張，設臨床科室39個，醫技科室19個，臨床教研室19個。有皮膚性病學、老年醫學、內科學(含8個三級學科)、神經病學4個博士學位授予點和1個臨床博士后科研流動站，碩士學位點覆蓋所有的臨床科室。

醫院擁有一批高素質的專家隊伍，其中博士生導師16人，副高職稱以上專家555人，中級職稱人員738人，博士和在讀博士120余人，碩士270人，享受國務院和省政府特殊津貼114人，擔任省級以上醫學學術團體負責人60多人，有4人入選全國"百千萬人才工程"，2人被衛生部授予“有突出貢獻的中青年專家”，省廳以上跨世紀學術技術帶頭人、骨干教師107人，位居安徽省醫療機構第一。

醫院年門診量143余萬人次，年住院病人6.9萬人次，年手術近2.5萬臺次，年教學工作量約1.7萬學時，年接收實習生、進修醫生1000余人。

醫院學科齊全，重點學科數在安徽省醫療機構中最多，有國家級重點學科1個，安徽省臨床醫學重點學科7個，安徽省臨床醫學重點發展學科16個，安徽省臨床醫學重點扶持學科2個，安徽省教育廳認定的重點學科3個，安徽省教育廳重點扶持學科1個，安醫大重點學科和重點扶持學科8個。省級重點實驗室1個，省部級共建重點實驗室1個。

醫院堅持科教興院戰略，學科技術水平不斷取得新的突破，受國家衛生部委托建立第一個中國人腦庫，填補國內空白;銀屑病的遺傳學研究處于國際領先水平，鹽裂皮膚免疫熒光技術診斷表皮下大皰病，國內領先。同種異體肝臟移植、自體干細胞移植、異體干細胞移植、異體腎臟移植、體外循環、心臟不停跳冠脈搭橋、心腦血管介入治療、胸腔和腹腔微創手術、輔助生殖技術、斷指再植和顯微外科等專業技術水平處國內先進水平。在中西醫結合治療大面積燒傷、微粒皮移植、顯微輸卵管復通手術、眼移角膜移植、人工晶體植入術和眼激光治療、小兒腦癱治療等方面積累了豐富的經驗,處省內領先地位。

近四年，醫院承擔包括中國人銀屑病易感基因研究、大別山隔離人群遺傳資源調查等國家863計劃和973計劃、國家自然科學基金、安徽省自然科學基金等科研課題200余項，其中2004、2005年、2006年、2007年共獲國家自然科學基金34項;獲省部級以上獎項30余項，其中2007年獲國家科技進步二等獎1項，教育部自然科學一等獎1項，2005、2006連續兩年獲中華醫學科技一等獎，都填補了安徽省醫療行業獲國家級獎項的空白。國家發表論文2137篇，出版專著103部，主辦5種國內外公開發行雜志：《肝膽外科雜志》、《臨床骨科雜志》、《臨床眼科雜志》、《臨床護理雜志》、《臨床肺科雜志》。醫院與美國、荷蘭、日本、香港等國家和地區的科學研究機構建立了密切的科研合作關系。

64排螺旋CT

ECT

X-刀治療及ZD系統

X線骨密度儀

分子激光眼治療儀

數字化減影成像系統

自動化檢驗全套設備

有4人入選全國"百千萬人才工程"，2人被衛生部授予“有突出貢獻的中青年專家”，省廳以上跨世紀學術技術帶頭人、骨干教師107人，位居安徽省醫療機構第一。

近四年，醫院承擔包括中國人銀屑病易感基因研究、大別山隔離人群遺傳資源調查等國家863計劃和973計劃、國家自然科學基金、安徽省自然科學基金等科研課題200余項，其中2004、2005年、2006年、2007年共獲國家自然科學基金34項;獲省部級以上獎項30余項，其中2007年獲國家科技進步二等獎1項，教育部自然科學一等獎1項，2005、2006連續兩年獲中華醫學科技一等獎，都填補了安徽省醫療行業獲國家級獎項的空白。國家發表論文2137篇，出版專著103部，主辦5種國內外公開發行雜志：《肝膽外科雜志》、《臨床骨科雜志》、《臨床眼科雜志》、《臨床護理雜志》、《臨床肺科雜志》。醫院與美國、荷蘭、日本、香港等國家和地區的科學研究機構建立了密切的科研合作關系。