南通市第三人民醫院始建于1962年，原為南通市傳染病醫院，現已發展成為一所集醫、教、研于一體的具有顯著專科特色的三級全民所有制綜合醫院，南通大學附屬南通第三醫院，江蘇省基本現代化醫院試點單位，附設南通市肝病研究所。　　醫院現有職工800余人，高級專家教授118人，開放床位606張，年門診量約25萬人次，年住院約10000余人次。醫院占地面積80畝，建筑面積30769㎡，設有1個分院，43個臨床醫技科室，2個門診部，8個社區衛生服務站，17個病區。　　　　醫院技術力量雄厚，建有以肝腎移植術、抗肝炎病毒、不停跳冠脈搭橋術及心內直視手術為標志的達到國內先進水平的九個醫療中心：肝病診治中心、肝腎移植中心、消化內鏡中心、心臟中心、肝癌及腫瘤診治中心、腎臟病診療研究中心、介入放射治療中心、骨科及斷肢（指）再植中心、燒傷整形醫療中心。

　　擁有美國GE永磁磁共振影像系統、螺旋CT、DSA、CR、全息彩色多譜勒超聲診斷儀、腹腔鏡、日本產人工肝支持系統、富士能系列電子內窺鏡、德國費森尤斯4008H聯機、血液透析濾過機及勞爾水處理系統等大型儀器設備。

　　醫院近年來取得省市科研成果21項，各項主要效率、質量和效益指標或平均增幅連續四年名列南通市市級醫院第1名。是全國首家“無紅包”醫院，江蘇省唯一的“全國職工職業道德建設先進單位”、是“全國衛生系統先進集體”、“江蘇省衛生系統先進集體”，“江蘇省衛生行風先進集體”、江蘇省委省政府表彰的“抗擊非典工作先進集體”、南通市“花園式單位”，并榮登市“十佳醫院”榜首。