1915年(民國4年)，其前身為吳縣公立醫院，為地方士紳作為慈善事業而興辦。當時一式平房，設備簡陋。北伐戰爭起，曾一度停辦。日偽時期，改為鐵道醫院，增建樓一座。 　　蘇州解放軍一零零規模漸大。抗日戰爭勝利后，醫院所有設備，被蘇州鐵路局運到常州戚墅堰。其時，國民黨江蘇省衛生廳長陳萬里(蘇州人)，利用第二次世界大戰后美國在遠東的戰爭剩余物資裝備醫院，并通過在美國善后救濟總署工作的蔣曾瑞，獲得一批醫療物資，在鐵道醫院原址籌建吳縣公立醫院。 　　蘇州解放后，由市軍管會派朱介琴(女，共產黨員)、楊格兩人到院接管，交蘇南行署衛生處領導，改名為蘇州市公醫院。 　　1950年春，交蘇南軍區衛生處領導，改為蘇南軍區醫院。 　　1953年春，蘇南、蘇北合并，成立江蘇軍區，改為江蘇省軍區中心醫院，院長姜斯培，政委孫洪春。新建病房接受500余名志愿軍傷員。另辟齊門外洋涇塘(現干休一所)為分院。 　　1956年，由軍委統編為一○○醫院。 　　1969年，整編為駐軍醫院。 　　1997年4月，由江蘇省軍區轉隸至南京軍區聯勤第十三分部。 　　2009年6月，婦產科、骨科、男科大民營企業家加入共建輝煌。