新疆醫科大學附屬腫瘤醫院成立于1989年;1993年自治區編委會批準醫院同時增掛新疆維吾爾自治區腫瘤防治研究所牌子，院所合一。2004年醫院被批準為新疆醫科大學第三臨床醫學院及新疆維吾爾自治區腫瘤防治中心。歷經24年的建設，現已成為集醫療、教學、科研和防治為一體的自治區級腫瘤專科醫院。 　　醫院現開放床位1500張，設33個臨床科室，15個醫技科室和38個職能單元;在崗職工2058人，其中高級專業技術人員214人，碩士、碩士以上學歷375人，博士生導師22名，碩士生導師59名，享受國務院政府特殊津貼專家3人，衛生部有突出貢獻中青年專家1人，自治區優秀專家2人;校級名師1人，院級名醫22人，單病種首席專家8人，學科帶頭人5名。 　　醫院擁有教育部省部共建重點實驗室，國家藥物臨床試驗機構，臨床醫學(腫瘤)博士后科研流動站，臨床醫學博士授權點，腫瘤學二級學科碩士授權點，一個國家級臨床醫學技術研究基地，三個自治區級質量控制中心和一個自治區級培訓基地。 　　近四年來共承擔縱向科研項目109項，其中國家科技部重大項目1項,國家自然基金項目17項，省部級項目44項，廳局級及醫科大學項目47項，科研經費近1700萬元，展現了較強的科研實力。腫瘤研究所重要技術平臺之一的標本資源庫，獲自治區、烏魯木齊市平臺建設資助，為科學研究提供了重要的基礎支持。 　　醫院近年獲中國抗癌協會科技獎1項，自治區科技進步二等獎4項,三等獎4項;獲新疆醫學科技進步獎3項，申請專利1項，獲批臨床藥物試驗1項。在省級以上刊物發表論文797篇，其中核心期刊收錄368篇，SCI收錄13篇;出版主編教材和專著6部。 　　2012年醫院門診量22萬余人次，收治住院患者4.1萬人次。