深圳市兒童醫院位于市中心區，1998年初正式開院，是一家集醫療、保健、科研、教學為一體的現代化綜合性兒童醫院和兒科急救中心，為深圳及周邊十幾個地區兒童提供醫療保健服務。醫院總建筑面積近17萬平方米，開放床位1000張。現設有10個兒內科病區、8個兒外科病區及重癥醫學、五官科、中醫、特需等病區，專業設置齊全，涵蓋了大型綜合兒童醫院全部業務科室。目前年門、急診量187.78萬人次，年住院量5.7萬人次，年手術量2.1萬例。醫院擁有價值逾4.2億的先進診療設備，包括3.0T磁共振、64排螺旋CT、DSA、24小時動態腦電圖、128H和64H數字化視頻腦電圖儀、血濾/血透器、氣質聯用儀、串聯質譜儀、流式細胞儀等，配有先進的層流無菌現代化手術室17間及早產兒無菌層流室。 　　深圳市兒童醫院是重慶醫科大學、汕頭大學醫學院、中國醫科大學、遵義醫學院、廣州中醫藥大學等院校非直屬附屬醫院或教學基地。現有職工1599人，高級職稱專業人才276人。其中，博士生導師3人，碩士生導師31人，享受國務院特殊津貼者1人，深圳市政府津貼者2人，歸國高級人才10名;博士后3人，醫學博士55，碩士328人。醫院設有兒科研究室，每年承擔多項國家、省、市科研課題。近年共獲得各級科研立項380余項，科研經費5200多萬元，包括國家科技部“863”項目、國家自然科學基金重點項目、面上項目、青年項目，省自然科學基金、人事部科研基金、衛生部行業重大項目合作者、省教育廳等項目，近3年發表SCI論文近50篇。醫院重視學科建設，經過十幾年的拼搏和積累，人才隊伍建設已經達到較高水平。兒科被評為廣東省重點專科，小兒呼吸專業為廣東省“十二五”醫學重點學科，小兒風濕與免疫專科為廣東省臨床特色專科;深圳兒童重癥疾病分子診斷重點實驗室被評為深圳市科技創新委重點實驗室;深圳病原體高通量基因測序技術工程實驗室被評為深圳市發改委重點工程實驗室;醫院擁有小兒血液腫瘤專業、免疫專業、小兒呼吸專業、小兒神經病學專業、新生兒科、兒童重癥醫學科及小兒外科七個市級醫學重點學科。 　　醫院十分注重人才建設，成功引進或培養了一批具有高學術影響力和地位的學科帶頭人和學科骨干，涵蓋海外高層次人才B類、C類，實用型人才Ⅰ類、Ⅱ類等。現有國家級學術團體主任委員8人、常委9人、委員62人，中華醫學會兒科各專業組委員12人，中國中西醫結合學會兒科分會常委兼血液組組長1人，中國醫師協會新生兒分會常務委員1人，《中華兒科雜志》、《中床兒科雜志》、《中華小兒外科雜志》、《中華耳鼻喉頭頸外科雜志》編委或通訊編委9人，中華醫學會兒科分會臨床藥學組副組長、中國醫師協會兒科風濕免疫學組副組長各1人，廣東省醫學會兒科分會、小兒外科分會副主委各1人，各專業組組長及副組長6人，廣東省醫生協會兒科分會副主委1人;同時是深圳市醫學會兒科分會、深圳市醫師協會兒科分會及深圳市中西醫結合學會兒科分會主委單位。