昌平縣醫院的前身“昌平縣大眾醫藥社”于1946年在長陵鄉上口村成立，1948年12月12日隨縣政府遷至昌平縣城。1949年3月“昌平縣大眾醫藥社”改稱為“昌平縣衛生院”。1956年“昌平縣衛生院”改稱為“昌平區衛生院”，同年秋后遷至昌平鎮和平街4號（現在院址）。1957年12月27日“昌平縣衛生院”升為“昌平區醫院”，1960年1月，“昌平區醫院”改稱為“昌平縣醫院”。 昌平縣醫院隸屬于昌平縣衛生局，是一所全縣歷史最長，規模最大的綜合醫院，是全縣醫療、急救、科研、教學、預防的中心。主要負責全縣區域內40余萬人的醫療急救工作；擔負著北京高等專科學校和昌平衛生學校教學實習任務；承擔全縣鄉鎮衛生院的業務指導和技術培訓工作；承擔大型活動的保健工作，如亞運會自行車賽場保健工作；承擔每年的高考體檢工作；完成上級業務主管部門下達的工作任務，承辦縣委縣政府交辦的各項工作，如1997年度全縣征兵體檢首次全部由昌平縣醫院獨家承擔，醫院克服重重困難，騰出房屋16間，抽調有關科室的技術骨干，嚴格執行體檢標準，全力以赴做好體檢工作，保質保量地圓滿完成了征兵體檢任務，接受了中央軍委領導的檢查，得到了領導的肯定和好評。這在全市范圍內獨家醫院承擔這樣大型的體檢任務尚屬首例。 昌平縣醫院是一所二級甲等綜合醫院，現有職工793人，床位447張。醫院科室齊全，設有內科，外科，婦產科、兒科、腫瘤科、中醫、針灸、按摩、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮膚性病科、功能檢查科、藥劑科、制劑科、麻醉科、病理科、理療科、防保科、激光治療室、手術室等30個科室。設有內科病房、外科病房、婦產科病房、兒科病房、腫瘤科病房、中西醫結合病房、五官科病房以及外賓、干部病房等13個病區和1個科研機構-臨床藥學研究室。專業專科建設齊全，外科設有普外、神外、胸外、泌尿外肛腸、小兒外、顯微外科等專業。內科設有心血管、血液病、消化病、內分泌、腎病、呼吸等專業，腫瘤設有腫內，腫外專業，以及婦科、產科和新生兒等專業專科。 行政后勤科室配套齊全，設有黨辦、工會共青團、院辦、管理辦、人事科、財務科、公費醫療辦、醫務科、科教科、門診部、護理部、大病統籌辦，感染辦、保衛科、總務科、基建科、器械科、固定資產辦等科室。 MRI、螺旋CT、數字胃腸機、C型臂、全自動生化分析儀等 昌平縣醫院隸屬于昌平縣衛生局是一所全縣歷史最長規模最大的綜合醫院是全縣醫療急救科研教學預防的中心