南通市肺科醫院原名南通市結核病防治院，始建于1972年，是蘇北地區唯一的一家診治呼吸系統疾病的市屬二級專科醫院，2003年5月8日因非典防治工作需要整體搬遷至南通市城港路31號（原蘆涇中學所在地）。醫院擁有占地面積44.33畝，建筑面積8747平方米，地理條件優越，交通便利，發展空間廣，醫院現有床位150張，在職職工123人，其中技術人員96人。高中級職稱40余人。醫院經過三十余年的探索實踐，刻苦努力和不斷積累，在呼吸系統疾病疹治方面取得了重大成就，對慢支、肺氣腫、哮喘、肺心病、肺部腫瘤等呼吸系統常見病的診治具有豐富的臨床經驗，對結核病尤其是難治性肺結核的診治有獨到之處。開展纖維支氣管鏡檢查近20年，診斷治療病例2000余，在市內率先開展了經纖支鏡肺活檢術，為肺部疑難雜癥的診斷提供了重要手段；開展了經纖支鏡微波治療支氣管內膜結核、支氣管腫瘤，以及采用雙套管保護性毛刷經纖支鏡下呼吸道取樣培養，大大提高了鑒定下呼吸道感染致病菌的準確率。近幾年醫院加強了結核病的基礎研究，并在結核菌耐藥基因研究方面取得了矚目成績。 醫院確定“以病人為中心”的服務宗旨，弘揚救死扶傷的人道主義精神，以高尚的醫德，精湛的醫術和低廉的收費標準，熱忱為廣大病員提供優質的服務。 　　擁有進口全身CT機、日立大型X光機、自動洗片機、纖維支氣管鏡、進口結核菌快速培養儀（能在一周內發現是否有結核菌生長）、有創和無創呼吸機、肺功能儀、心理監護儀等門類齊全，能滿足呼吸系統疾病早診早治需要的醫療設備。