武警內蒙古總隊醫院組建于1961年11月，其前身是中國人民解放軍第三五六醫院。經過44年的建設和發展，目前醫院已成為學科齊全、技術力量雄厚，設備先進，診療條件優良，集醫療、教學、科研、預防為一體的綜合性醫院，1996年通過武警總部“三級乙等醫院”評審，同時定為內蒙古醫學院教學醫院。

醫院擁有螺旋CT，重癥監護儀，彩色多普勒超聲診斷儀，電子胃鏡，血液透析機，血濾機，電視腹腔手術鏡，多功能麻醉機，呼吸機，數字胃腸造影機，血液流變儀，血氣分析儀，顯微形態分析系統，自動生化分析儀，鼻內窺鏡、動態心電圖、體外碎石機、關節腔鏡、經顱彩色多普勒等大型高、精、尖醫療設備

1996年醫院被評為自治區文明醫院。