甘肅省鐵路中心醫院始建于1958年，是集醫療、教學、科研及預防保健為一體的綜合性國家三級乙等醫院，甘肅省、蘭州市城鎮職工基本醫療保險定點醫療機構。移交甘肅省地方政府管理后，該院定性為全民所有制事業單位，是政府舉辦的非營利性醫療機構，按照市場化機制運作，醫療服務價格執行政府指導價。省衛生廳對醫院人事、黨務、行政進行直屬管理，同時對國有資產進行監督，對業務進行指導。