東莞市婦幼保健院始建于1951年，是東莞市唯一一所三級甲等婦幼保健機構，集醫療、保健、科研、教學、基層指導為一體，承擔了全市婦女兒童的醫療保健、健康教育、培訓、婦幼衛生信息收集與統計、科研等工作任務。2017年，按照大部制改革的意見,完成東莞市婦幼保健院和市計劃生育服務中心合并,在醫院掛牌成立市婦幼保健計劃生育服務中心，優化整合了婦幼保健與計劃生育技術的服務資源。現在醫院設有東城總院區、莞城院區、南城院區。醫院占地面積6.7萬平方米，建筑面積6.8萬平方米。擁有職工1564人，衛生技術人員1279人，其中碩博 95 人，高級職稱171人；設置了16個職能科室，43個業務科室、12個醫療輔助科室。編制床位980張，實際開放700張；裝備了價值3.5億多元的各類醫療設備，包括3.0T核磁共振、64排螺旋CT、實時四維彩色超聲診斷儀、口腔CT、基因測序儀、移動式C型臂X射線機、全數字化乳腺鉬鈀機、超聲聚焦子宮肌瘤治療系統、血紅蛋白毛細管電泳儀等先進設備；2018年出院病人達4.2萬人次；門診量達到180萬人次。醫院目前為南方醫科大學非直屬附屬醫院、遵義醫學院珠海校區臨床教學實踐基地，國家住院醫師規范化培訓基地東莞市人民醫院的協同基地，承擔婦產科和兒科的住院醫師規范化培訓和臨床本科實習帶教任務。2016年12月，醫院通過JCI國際認證，實現了醫院的精細化管理，婦幼保健、醫療服務保障的能力得到進一步的增強。2017年，國家衛生計生委授予我院“全國衛生計生系統先進集體”稱號。 醫院按照“五部一所”（孕產保健部、婦女保健部、兒童保健部、計劃生育服務部、綜合保健部、東莞市生殖與遺傳研究所）的架構開展業務工作，建成產科、新生兒科、小兒神經專科、兒童重癥監護室、兒童保健科、康復醫學科等6個市級醫學重點專科以及婦科、助產專科等2個市級醫學特色專科，形成了醫院的專科品牌。