上海市崇明縣傳染病醫院是專業收住急慢性傳染病的縣級專科醫院，肩負著全島人民傳染病的防治工作。該院創建于1984年，是國家肝病健康教育計劃實施基地，結核病防治臨床基地，在業務上與上海肺科醫院建立協作關系，是一所體制健全、資歷深厚、經驗豐富，具有公共衛生突發事件應對能力的現代化、園林化醫院。 崇明縣傳染病醫院配置了先進的醫療儀器，擁有630MA多功能數字化X光機、放射成像系統、彩色多普勒診斷系統、全自動生化分析儀、微生物鑒定及藥敏分析系統、時間分辨熒光免疫分析系統、重危監護系統、心肺功能檢測儀、腹水回收治療儀、肝病治療儀、支氣管鏡、人工肝及呼吸機等一系列高精尖儀器