肌肉萎縮的病因主要分為神經源性肌肉萎縮和肌源性肌肉萎縮,神經源性肌肉萎縮常見的原因是廢用、營養障礙、缺血和中毒,前角病變、神經根、神經叢、周圍神經的病變等,均可以引起神經興奮沖動的傳導障礙,從而使部分肌纖維的廢用,產生廢用性肌肉萎縮。
另一方面,當下運動神經元,任何部位發生損害以后,它到末梢部位釋放的乙酰膽堿會減少,交感神經營養作用的減弱,從而導致肌肉的萎縮。
另外是肌源性肌肉萎縮,肌源性肌肉萎縮是肌肉本身的疾病,可能還會包括一些其它的因素,比如肩帶或面肩肱型的肌肉營養不良的患者。
通過形態學檢查,證實為脊髓型肌肉萎縮,用微電極技術檢查,患者肌營養不良的動物,顯示機能性失神經肌纖維者約占三分之一,兩大類主要因素可以引起肌肉萎縮,神經受損,稱神經源性肌肉萎縮。肌肉本身的疾病,稱為肌源性肌萎縮。