目前為止，還沒有明確的證據顯示，藥物對厭食癥患者的體重增長或者是核心癥狀有顯著改善作用，不建議作為治療神經性厭食的單獨或者是主要方法。
神經性厭食的精神藥物治療，主要是用于減輕患者的焦慮或者是激惹、敵對等情緒癥狀。協助飲食恢復或者是心理治療或緩解相關的控欲問題。應該謹慎使用藥物治療，厭食癥患者的焦慮、抑郁或強迫癥狀，因為這些可能單靠體重增加就能緩解。如果說厭食癥患者在體重恢復正常以后，仍有貪食、易于焦慮或強迫癥狀，就可以選擇應用選擇性五羥色胺再攝取抑制劑類藥物。
當使用藥物治療神經性厭食患者的時候，應該認真的考慮藥物治療的不良反應，特別是心臟方面的不良反應。對心臟并發癥風險的神經性厭食癥患者，應該避免使用可能損害心臟功能的藥物，如果必須使用，應該進行心電監護。
另外，安非他酮在神經性貪食患者當中，可能會引發癲癇發作，增加癲癇的可能性，尤其是伴有貪食癥狀的神經性厭食癥的患者。雖然，沒有藥物試驗對選擇性五羥色胺再攝取抑制劑以外的其他抗抑郁藥，在這個神經性厭食患者當中的一個療效對比觀察。但是，因為抗抑郁藥更容易在營養不良的患者當中，引起不良反應，所以說應該盡量的避免。抗精神病藥物，尤其是奧氮平、利培酮、阿立哌唑已經被用于少數的患者，仍然需要從小劑量開始，注意觀察它的不良反應。
