腎臟感染的這種通常為突發性寒戰、發熱、雙側腰部疼痛、惡心和嘔吐,約三分之一的腎臟感染病人也同時有下尿路感染癥狀,包括尿頻、尿痛,可得一側或雙側腎臟擴大和有觸痛,感染側背部的小范圍區域有壓痛。
有時腹肌嚴重收縮,病人可能發生震懾的劇烈疼痛,它是由于一側輸尿管痙攣所致,這時絞痛可能由于感染或是腎結石通過輸尿管的集熱所引起。在患兒腎上感染的癥狀通常極微,長期感染的疼痛可模糊不清,可反復發熱或完全不發熱,尿頻性腎盂腎炎常發生在有潛在畸形的患者。如尿路梗阻持續存在的腎結石,患兒最常見的是尿膀胱、輸尿管反流。