一般來說,這種疾病的臨床表現多樣化,主要取決于腎結核病變范圍以及輸尿管膀胱繼發結核的嚴重程度,在疾病早期時患者可以沒有明顯的臨床表現,發展至臨床腎結核病時,患者可以出現無癥狀血尿,微量白蛋白尿,白細胞尿等,病變蔓延至膀胱時,患者可以出現尿急、尿頻、尿痛、排尿困難、等膀胱刺激癥狀。
膀胱刺激癥是腎結核最常見的首發癥狀,特別是患者出現尿頻,其次為血尿,約有一半以上的患者會有肉眼血尿的發生,腎結核的主要病變在于腎臟,但是腎臟本身癥狀并不十分多見,僅有少數患者有腎區疼痛或者是腰部腫物,通常伴有發熱,此時腎臟已經嚴重破壞,已發展成為結核性腎膿腫,有些患者還會出現發熱、盜汗、消瘦等結核病表現,晚期雙腎結核或一側腎結核時并伴發對側嚴重腎積水時可以出現貧血,食欲不振、惡心、嘔吐等慢性腎衰竭癥狀,也有些患者會發生急性無尿。