治療房顫的抗凝藥物，常用的就是華法林。
華法林是目前臨床研究最充分，而且抗凝效果最好的一種藥物。但是華法林用起來是比較麻煩的，相對來說是麻煩一點。因為華法連需要經常要監測國際標準化比值，服用華法林的患者需要經常調整藥物的劑量，而且還要注意平時的飲食。
因為華法林和很多的蔬菜以及其他的藥物都有相互的作用，一旦服用抵抗類的食物，就可以導致華法林的作用減弱，引發血栓形成的可能性。所以病人在服用華法林的時候一定要定期到醫院檢測國際標準化比值，即使國際標準化比值在合理的范圍之內，也應當定期去檢測，避免發生太大的波動。
目前來說，還有新型的口服抗凝藥物來治療房顫。隨著新型口服抗凝藥物的陸續上市，指南的地位也在不斷的上升。目前來說，已經做了新型口服抗凝藥的大量研究，而且目前新型口服抗凝藥物的推薦級別和華法林是相同的。新型口服抗凝藥物簡單，安全，有效，可以明顯的改善生活質量，而且不需要監測國際標準化比值，很少和食物以及其他藥物產生相互作用。
在2014年美國acc的房顫管理指南中，新型口服抗凝藥物已經成為了Ⅰb類的推薦，其中有達比加群，利伐沙班，阿哌沙班等等。如果服用華法林不能將INR穩定的控制在治療窗之內，都建議采用新型口服抗凝藥物來進行抗凝治療。
