隱睪患者的預后主要涉及生育能力和睪丸惡變兩方面,接受正規治療的單側隱睪患者,成年后生育能力并不比正常對照人群顯著降低,雙側隱睪患兒即使接受治療,生育能力比單側者、正常對照有明顯的降低,雙側約62%,單側約89%,對照約94%的可以生育子女。
在所有睪丸腫瘤中大約10%可以來自隱睪疾病。有一些文獻認為,隱睪癥男性睪丸腫瘤的發病率的相對危險度是一般人群的四十倍,然而近期的文獻統計認為,隱睪癥男性睪丸腫瘤的相對危險,是非隱睪男性的兩到八倍。
手術不能降低腫瘤的危險,但可使睪丸更易被檢查。隨訪包括常規的自我檢查,在觸及異常睪丸后需及時就診,進一步行超聲檢查,測定血漿腫瘤標記物,對青春期后的隱睪行睪丸固定術存在爭議,對于選擇保留睪丸方案者應小心的隨訪和觀察。