尿路感染對結石形成有明顯的影響,細菌及其引起的膿塊、壞死組織,可作為結石的核心。炎癥產生的有機物可能擾亂尿中膠體和晶體的平衡,不穩定膠體的沉積也可成為結石的核心。腎盂腎炎時能產生尿素酶的細菌,將尿素分解為氨和二氧化碳,尿素具有保護性膠體作用,尿素經細菌分解后,其含量減少,因而,降低了保護性膠體作用。更重要的是,尿素分解出來的氨與水化合成氫氧化銨,大大增加了尿的pH值。
此時銨與尿中鎂和磷酸根結合成的磷酸鎂銨呈高度過飽和而析出;在堿性條件下,尿中的鈣和磷酸根相結合形成磷灰石。另外,尿路梗阻(如腎盂輸尿管連接處狹窄),與長期臥床者易引起尿淤積,促使尿中晶體易于沉淀而導致結石的形成。