維生素D缺乏對腸道的影響,主要是因為維生素D的本身可以作用于腸細胞的表面,然后讓鈣離子比較容易通過腸道細胞黏膜的屏障,進入到細胞內細胞質內會含有比較高濃度的維生素D的受體,可以促進腸粘膜上皮細胞合成鈣結合蛋白,附近小腸內的腸的鈣的轉運,另外維生素D也能夠激發腸道對磷的轉移過程,這種轉運是比較獨立的,鈣磷轉運兩個相互獨立互不受影響,所以說維生素D缺乏對腸道的影響就是會導致長對腸道對鈣的吸收減少。
對骨骼方面的影響,維生素D他可以和甲狀腺協同,使沒有常熟的破骨細胞的前體細胞轉化為成熟的細胞然后,促進骨質吸收,讓比較舊的骨頭里面的骨鹽溶解,鈣磷轉移到血內提高血鈣血磷的濃度,另外一方面也刺激成骨細胞促進骨樣組織成熟和骨炎的沉著。