反應性關節(jié)炎依據(jù)病史，臨床特點，反應性關節(jié)炎的診斷并不是太困難，但是對于一些不典型的，以及慢性經(jīng)過的病例，需要跟一些疾病進行鑒別，最起碼需要跟強直性脊柱炎相鑒別。強直性脊柱炎緩慢起病，以下腰部疼痛為主，可呈上行性，患者有可能伴有非對稱性的下肢大關節(jié)疼痛、腫脹，以寬關節(jié)、膝關節(jié)、踝關節(jié)最常見，也有可能會累及上肢關節(jié)。
強直性脊柱炎的腰背疼痛以及關節(jié)炎病程緩慢，與反應性關節(jié)的急性過程不同，此外強直性脊柱炎骶髂關節(jié)炎多呈對稱性，脊柱受累為上行性，這就是分類未定的脊柱關節(jié)病，這種情況一般是具有脊柱關節(jié)病的臨床實驗室特征，暫時不符合某一種疾病的診斷，該病可能為某種脊柱關節(jié)的早期或者是獨立的疾病。
另外，需要跟化膿性關節(jié)炎相鑒別，化膿性關節(jié)炎為關節(jié)腔本身的感染導致的，一般發(fā)病比較急，往往是單關節(jié)受累，表現(xiàn)為關節(jié)局部的紅、腫、熱、痛這樣的表現(xiàn)。一般化驗血常規(guī)，會有白細胞的升高。
